应用基因组工具帮助保护面对树皮甲虫威胁的托利松

Dr. 斯蒂芬妮·斯蒂尔，圣地亚哥动物园全球公司 

托利松(Pinus torreyana)是一种稀有的, 这种标志性物种只在南加州的两个地方自然存在:沿海的圣地亚哥县和圣罗莎岛. 由于长期干旱增加了树木对树皮甲虫Ips paraconfusus攻击的易感性，该物种特别值得保护. 近年来，Ips甲虫对大陆的树木构成了重大挑战. 而托里松的遗传多样性水平非常低, 有可能基因变异是抵抗甲虫的基础，从而决定了, 至少部分是这样, 哪些树存活了下来. 为了测试这个, 我们正在使用RNA-Seq来调查托里松的功能遗传多样性，这些托里松要么死于树皮甲虫，要么没有症状. 我们的目标是1)表征该物种的功能遗传多样性, 尤其是防御相关基因, 2)检测病树与无病树的遗传分化, 3)确定特定的基因变异是否与生存有关. 这项工作将深入了解托利松对持续树皮甲虫爆发的适应潜力，并将为这一标志性物种的未来恢复工作提供信息.